Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aebp1Q640N1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aebp1Q640N1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms