Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc18Q640L5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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