Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CochQ62507 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CochQ62507 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CochQ62507 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CochQ62507 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CochQ62507 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms