Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vat1Q62465 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms