Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp4Q62445 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms