Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxa13Q62424 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa13Q62424 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms