Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccl12Q62401 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms