Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcbp2Q61990 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcbp2Q61990 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms