Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd53Q61451 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cd53Q61451 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd53Q61451 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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