Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsx2Q61412 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms