Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf4bQ61136 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpf4bQ61136 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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