Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nab1Q61122 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms