Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trpc1Q61056 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc1Q61056 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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