Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ift20Q61025 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift20Q61025 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms