Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lama5Q61001 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lama5Q61001 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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