Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
JrkQ60976 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
JrkQ60976 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
JrkQ60976 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms