Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grik1Q60934 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms