Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Neurod1Q60867 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Neurod1Q60867 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms