Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf8Q60846 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf8Q60846 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms