Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfaip3Q60769 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfaip3Q60769 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms