Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms