Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ItgaeQ60677 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ItgaeQ60677 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms