Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sin3aQ60520 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sin3aQ60520 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms