Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpn1lQ5XFR0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms