Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dnajc11Q5U458 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnajc11Q5U458 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnajc11Q5U458 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnajc11Q5U458 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dnajc11Q5U458 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms