Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Myh1Q5SX40 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms