Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd40Q5SUE8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms