Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Sco1Q5SUC9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Sco1Q5SUC9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sco1Q5SUC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Sco1Q5SUC9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sco1Q5SUC9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms