Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tns3Q5SSZ5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tns3Q5SSZ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms