Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psme4Q5SSW2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psme4Q5SSW2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms