Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc88aQ5SNZ0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms