Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RilpQ5ND29 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RilpQ5ND29 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms