Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Trim41Q5NCC3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms