Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttf2Q5NC05 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttf2Q5NC05 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms