Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrc3Q5DU56 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nlrc3Q5DU56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nlrc3Q5DU56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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