Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfmbt2Q5DTW2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfmbt2Q5DTW2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms