Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam208bQ5DTT3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam208bQ5DTT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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