Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLK4

Zcchc6, Terminal uridylyltransferase 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc6Q5BLK4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zcchc6Q5BLK4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zcchc6Q5BLK4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms