Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndufaf2Q59J78 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms