Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E2f8Q58FA4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E2f8Q58FA4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms