Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Urb1Q571H0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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