Protein–RNA interactions for Protein: Q497J0

BC100530, MCG130175, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC100530Q497J0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC100530Q497J0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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BC100530Q497J0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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BC100530Q497J0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC100530Q497J0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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