Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam220aQ3ZN08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fam220aQ3ZN08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fam220aQ3ZN08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam220aQ3ZN08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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