Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim26Q3V460 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms