Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ckap2Q3V1H1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms