Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc110Q3V125 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc110Q3V125 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms