Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc185Q3V118 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms