Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms