Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc9Q3V038 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Ttc9Q3V038 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ttc9Q3V038 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ttc9Q3V038 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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