Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hipk4Q3V016 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hipk4Q3V016 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms